Gebze’nin en eski köylerinden olan Ahatlı 800 yıllık bir geçmişe sahip olduğu biliniyor. Köyün adının nereden geldiğine dair kesin bir bilgi yok. Fakat köyün yeni yerleşim olduğu sıralarda bir genç kızın atın üzerinde ki delikanlıya gönlünü kaptırıp içini çekerek, ‘ah atlı ah’ demesinden esinlenerek köyün adının Ahatlı olduğu söylenir. Gebze merkeze 42 km uzaklıkta olan Ahatlı’da bir çok eski bina ise şimdilerde yıkılmış veya yıkılmak üzere. Bakımsızlık ve ilgisizlikten ötürü köyün eski ahşap yapıları zamana daha çok dayanamayarak yok olup gidiyor. Oysa bu eski evlerden bazıları koruma altına alınarak bu köyün tarihi ve sosyal yaşamına katkı sunulabilir.
Cengiz AKGÜN